体制机制建设是推动创新发展的必要手段。甘肃工程咨询集团着力构建以建设项目为依托、以技术研究为核心、以高端人才为支撑、以成果应用为目标的创新体系，强化战略统筹，加强分类指导，突出融合协同。制定《强科技行动实施方案（2023-2025）》，设置34项重点任务，清单化管理推进；制定《科技项目管理办法》《科技项目计划名录建设工作实施意见》等10余项科技创新制度，持续完善制度体系，常态化构建长效机制。强化总部科技创新规划引领作用，突出子企业创新主体地位，创新成果实现量质齐升。加强科创平台建设，优化研发资金、技术、人才、基础设施等创新资源配置，成立大师工作室、黄河流域高质量发展和生态保护研究中心、国土空间规划编制研究中心等17个科创中心及团队，围绕国家和区域发展重大战略，开展前沿理论和技术研究。强化激励保障，对科研人员进行股权激励，推动绩效薪酬向研发一线倾斜，最大程度调动创新积极性。厚植“人才是第一资源”理念，打造有利于推动科技创新工作快速发展的专业干部队伍，近三年引进博士、硕士研究生330余人，建立拔尖人才选拔培养机制，充分发挥“头雁”人才创新引领作用，切实把人才活力转化为创新动力，为高质量发展提供强劲智力支撑。

在创新实践中，甘肃工程咨询集团推进创新链、产业链、资金链、人才链深度融合，通过期权、股权奖励、分红等激励形式，激发科研人员创新动力与活力。主动加强与大型企业、科研院所、研究型高校的合作，共建需求对接、优势互补、利益共享的科技成果转化机制。推动数字技术与创新生态系统高度协同耦合，提高科技创新系统对企业高质量发展的促进效率。推动核心优势技术与市场需求高效对接，使“好技术”变成项目实施中的“新应用”，成为市场竞争的“新势力”。